NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
432060 | 2jrm | 15339 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_2jrm save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1001 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 1077 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 1693.133 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.452 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0247 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0042 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0786 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 1 MET 0.000 0.000 . 0 "[ . 1 . 2]" 1 2 LYS 0.054 0.054 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 3 ARG 0.740 0.220 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 4 GLN 1.980 0.308 16 0 "[ . 1 . 2]" 1 5 LYS 1.878 0.308 16 0 "[ . 1 . 2]" 1 6 ARG 0.884 0.087 3 0 "[ . 1 . 2]" 1 7 ASP 1.954 0.213 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 8 ARG 2.146 0.213 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 9 LEU 3.295 0.173 2 0 "[ . 1 . 2]" 1 10 GLU 0.158 0.042 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 11 ARG 4.378 0.283 2 0 "[ . 1 . 2]" 1 12 ALA 2.698 0.133 19 0 "[ . 1 . 2]" 1 13 GLN 3.936 0.283 2 0 "[ . 1 . 2]" 1 14 SER 0.673 0.195 3 0 "[ . 1 . 2]" 1 15 GLN 0.779 0.095 3 0 "[ . 1 . 2]" 1 16 GLY 0.008 0.008 3 0 "[ . 1 . 2]" 1 17 TYR 1.743 0.094 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 18 LYS 2.853 0.173 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 19 ALA 1.766 0.167 16 0 "[ . 1 . 2]" 1 20 GLY 3.890 0.279 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 21 LEU 3.328 0.173 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 22 ASN 6.402 0.402 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 23 GLY 4.041 0.279 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 24 ARG 7.843 0.452 4 0 "[ . 1 . 2]" 1 25 SER 5.062 0.163 16 0 "[ . 1 . 2]" 1 26 GLN 5.321 0.255 11 0 "[ . 1 . 2]" 1 27 GLU 1.614 0.255 11 0 "[ . 1 . 2]" 1 28 ALA 2.736 0.163 16 0 "[ . 1 . 2]" 1 29 CYS 2.103 0.164 1 0 "[ . 1 . 2]" 1 30 PRO 2.678 0.119 17 0 "[ . 1 . 2]" 1 31 TYR 0.142 0.052 11 0 "[ . 1 . 2]" 1 32 GLN 3.656 0.171 17 0 "[ . 1 . 2]" 1 33 GLN 10.486 0.235 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 34 VAL 2.256 0.171 17 0 "[ . 1 . 2]" 1 35 ASP 3.977 0.417 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 36 ALA 6.957 0.417 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 37 ARG 1.034 0.126 1 0 "[ . 1 . 2]" 1 38 SER 3.733 0.229 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 39 TYR 6.125 0.229 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 40 TRP 1.555 0.106 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 41 LEU 0.855 0.157 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 42 GLY 0.435 0.157 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 43 GLY 0.150 0.040 3 0 "[ . 1 . 2]" 1 44 TRP 0.619 0.079 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 45 ARG 0.225 0.056 10 0 "[ . 1 . 2]" 1 46 ASP 0.572 0.067 1 0 "[ . 1 . 2]" 1 47 ALA 0.222 0.079 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 48 ARG 0.530 0.132 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 49 ASP 0.843 0.149 14 0 "[ . 1 . 2]" 1 50 GLU 6.438 0.378 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 51 LYS 5.448 0.290 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 52 GLN 13.057 0.378 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 53 SER 0.811 0.065 16 0 "[ . 1 . 2]" 1 54 GLY 0.927 0.124 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 55 LEU 2.359 0.252 11 0 "[ . 1 . 2]" 1 56 TYR 2.161 0.224 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 57 LYS 2.401 0.252 11 0 "[ . 1 . 2]" 1 58 LEU 4.091 0.308 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 59 GLU 1.681 0.308 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 60 HIS 0.136 0.070 14 0 "[ . 1 . 2]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 1 MET HA 1 2 LYS H 4.000 . 5.000 2.665 2.107 3.593 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 2 1 1 MET QB 1 2 LYS H 4.000 . 5.000 3.057 1.900 3.997 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 3 1 2 LYS H 1 2 LYS QG 4.000 . 5.000 3.323 1.893 4.268 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 4 1 2 LYS HA 1 2 LYS QD 4.000 . 5.000 3.967 2.988 4.513 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 5 1 2 LYS HA 1 3 ARG H 4.000 . 5.000 2.816 2.147 3.583 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 6 1 2 LYS QB 1 2 LYS QE 4.000 . 5.000 3.224 1.975 3.815 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 7 1 2 LYS HB2 1 3 ARG H 4.000 . 5.000 3.956 2.729 4.662 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 8 1 2 LYS HB3 1 3 ARG H 4.000 . 5.000 3.480 1.746 4.457 0.054 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 9 1 3 ARG H 1 3 ARG QG 4.000 . 5.000 3.358 2.123 4.230 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 10 1 3 ARG H 1 4 GLN H 3.000 . 3.500 2.699 1.636 3.720 0.220 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 11 1 3 ARG HA 1 3 ARG QD 4.000 . 5.000 3.669 1.788 4.248 0.012 2 0 "[ . 1 . 2]" 1 12 1 3 ARG HA 1 4 GLN H 4.000 . 5.000 3.037 2.243 3.601 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 13 1 3 ARG QB 1 4 GLN H 4.000 . 5.000 3.421 2.112 4.043 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 14 1 3 ARG QG 1 4 GLN H 4.000 . 5.000 4.089 1.789 4.691 0.011 19 0 "[ . 1 . 2]" 1 15 1 4 GLN H 1 4 GLN HB2 4.000 . 5.000 2.795 2.237 3.627 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 16 1 4 GLN H 1 4 GLN HB3 4.000 . 5.000 3.503 2.682 4.078 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 17 1 4 GLN H 1 4 GLN QG 4.000 . 5.000 2.843 1.798 4.258 0.002 7 0 "[ . 1 . 2]" 1 18 1 4 GLN H 1 5 LYS H 4.000 . 5.000 3.235 1.718 4.545 0.082 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 19 1 4 GLN HA 1 5 LYS H 3.000 . 3.500 2.858 2.156 3.532 0.032 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 20 1 4 GLN HA 1 7 ASP HB2 4.000 . 5.000 3.464 1.975 4.808 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 21 1 4 GLN HA 1 7 ASP HB3 4.000 . 5.000 4.130 2.958 4.863 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 22 1 4 GLN QB 1 5 LYS H 4.000 . 5.000 3.301 2.008 4.013 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 23 1 4 GLN QB 1 5 LYS QG 4.000 . 5.000 4.794 4.211 5.308 0.308 16 0 "[ . 1 . 2]" 1 24 1 4 GLN QB 1 7 ASP H 4.000 . 5.000 3.786 2.003 4.995 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 25 1 4 GLN QB 1 7 ASP HB2 4.000 . 5.000 3.007 1.708 5.010 0.092 17 0 "[ . 1 . 2]" 1 26 1 4 GLN QB 1 7 ASP HB3 4.000 . 5.000 3.582 1.842 5.015 0.015 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 27 1 5 LYS H 1 5 LYS QB 3.000 . 3.500 2.458 2.161 2.904 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 28 1 5 LYS H 1 6 ARG H 4.000 . 5.000 2.568 2.238 2.924 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 29 1 5 LYS H 1 7 ASP QB 4.000 . 5.000 4.629 4.027 5.031 0.031 14 0 "[ . 1 . 2]" 1 30 1 5 LYS HA 1 5 LYS QD 4.000 . 5.000 3.590 1.929 4.479 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 31 1 5 LYS HA 1 6 ARG H 3.000 . 3.500 3.516 3.423 3.562 0.062 2 0 "[ . 1 . 2]" 1 32 1 5 LYS HA 1 8 ARG QG 4.000 . 5.000 3.307 2.232 5.018 0.018 18 0 "[ . 1 . 2]" 1 33 1 5 LYS QB 1 5 LYS QE 4.000 . 5.000 2.847 1.786 3.852 0.014 5 0 "[ . 1 . 2]" 1 34 1 5 LYS QB 1 6 ARG H 4.000 . 5.000 2.853 2.059 3.630 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 35 1 5 LYS QB 1 9 LEU MD1 4.000 . 5.000 3.372 2.370 4.331 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 36 1 5 LYS QD 1 6 ARG H 4.000 . 5.000 4.547 4.014 4.984 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 37 1 5 LYS QE 1 9 LEU MD1 4.000 . 5.000 4.040 2.632 5.099 0.099 4 0 "[ . 1 . 2]" 1 38 1 6 ARG H 1 9 LEU MD1 4.000 . 5.000 4.391 3.779 5.017 0.017 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 39 1 6 ARG HA 1 6 ARG QD 4.000 . 5.000 3.857 2.016 4.257 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 40 1 6 ARG HA 1 7 ASP H 3.000 . 3.500 3.481 3.388 3.529 0.029 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 41 1 6 ARG HA 1 9 LEU HB2 4.000 . 5.000 2.428 1.996 2.894 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 42 1 6 ARG HA 1 9 LEU HB3 4.000 . 5.000 3.986 3.510 4.504 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 43 1 6 ARG HA 1 9 LEU MD1 4.000 . 5.000 2.750 1.862 3.220 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 44 1 6 ARG QB 1 7 ASP H 3.000 . 3.500 2.782 2.512 3.115 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 45 1 6 ARG QG 1 7 ASP H 4.000 . 5.000 3.895 3.372 4.509 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 46 1 6 ARG QG 1 9 LEU HB2 4.000 . 5.000 3.694 2.520 4.262 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 47 1 6 ARG QG 1 9 LEU HB3 4.000 . 5.000 4.663 3.355 5.087 0.087 3 0 "[ . 1 . 2]" 1 48 1 6 ARG QG 1 9 LEU MD1 4.000 . 5.000 4.196 2.578 4.980 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 49 1 6 ARG QG 1 10 GLU QG 4.000 . 5.000 4.167 2.060 5.027 0.027 7 0 "[ . 1 . 2]" 1 50 1 6 ARG QD 1 10 GLU QB 4.000 . 5.000 4.114 1.926 5.017 0.017 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 51 1 7 ASP H 1 7 ASP HB2 4.000 . 5.000 2.494 2.336 2.746 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 52 1 7 ASP H 1 7 ASP HB3 4.000 . 5.000 3.077 2.353 3.611 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 53 1 7 ASP H 1 8 ARG H 4.000 . 5.000 2.887 2.664 3.174 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 54 1 7 ASP HA 1 8 ARG H 4.000 . 5.000 3.543 3.496 3.581 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 55 1 7 ASP HA 1 10 GLU H 4.000 . 5.000 3.719 3.076 4.140 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 56 1 7 ASP HA 1 10 GLU QB 4.000 . 5.000 3.067 2.360 3.663 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 57 1 7 ASP HA 1 11 ARG H 4.000 . 5.000 4.397 3.803 4.784 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 58 1 7 ASP HB2 1 8 ARG H 4.000 . 5.000 2.953 1.916 3.754 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 59 1 7 ASP HB3 1 8 ARG H 4.000 . 5.000 2.731 1.995 3.494 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 60 1 7 ASP HB2 1 8 ARG QB 4.000 . 5.000 4.541 3.515 5.213 0.213 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 61 1 7 ASP HB3 1 8 ARG QB 4.000 . 5.000 4.072 3.439 4.868 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 62 1 8 ARG H 1 8 ARG HG2 4.000 . 5.000 2.711 1.899 4.542 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 63 1 8 ARG H 1 8 ARG HG3 4.000 . 5.000 3.641 2.986 4.435 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 64 1 8 ARG H 1 9 LEU H 4.000 . 5.000 2.586 2.409 2.836 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 65 1 8 ARG HA 1 8 ARG QD 4.000 . 5.000 3.958 2.024 4.645 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 66 1 8 ARG HA 1 9 LEU H 4.000 . 5.000 3.452 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