NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | in_recoord | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
36606 |
1nxi   |
5589 | cing | recoord | 2-parsed | STAR | entry | full | 1268 |
data_1nxi_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1nxi
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1nxi 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1nxi
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1nxi "Master copy" parsed_1nxi
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1nxi
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1nxi.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1nxi 1
1 1nxi.mr . . XPLOR/CNS 2 distance "hydrogen bond" simple 116 parsed_1nxi 1
1 1nxi.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 1035 parsed_1nxi 1
1 1nxi.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 117 parsed_1nxi 1
1 1nxi.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1nxi 1
stop_
save_
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_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1nxi
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION 10-FEB-03 1NXI
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF VIBRIO CHOLERAE PROTEIN VC0424
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN VC0424;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: VIBRIO CHOLERAE;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: BACTERIA;
*SOURCE 4 GENE: VC0424;
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_COMMON: BACTERIA;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: ROSETTA (LAMDADE3);
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PET28B
*KEYWDS STRUCTURAL GENOMICS, AB SANDWICH, COG 3076, ATCC NO. 51394D,
*KEYWDS 2 NESG TARGET OP3
*EXPDTA NMR, 20 STRUCTURES
*AUTHOR T.A.RAMELOT, S.NI, S.GOLDSMITH-FISCHMAN, J.R.CORT, B.HONIG,
*AUTHOR 2 M.A.KENNEDY
*REVDAT 1 01-JUL-03 1NXI 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1nxi
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1nxi 1
2 1 . . . parsed_1nxi 1
3 1 . . . parsed_1nxi 1
4 1 . . . parsed_1nxi 1
5 1 . . . parsed_1nxi 1
6 1 . . . parsed_1nxi 1
7 1 . . . parsed_1nxi 1
8 1 . . . parsed_1nxi 1
9 1 . . . parsed_1nxi 1
10 1 . . . parsed_1nxi 1
11 1 . . . parsed_1nxi 1
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13 1 . . . parsed_1nxi 1
14 1 . . . parsed_1nxi 1
15 1 . . . parsed_1nxi 1
16 1 . . . parsed_1nxi 1
17 1 . . . parsed_1nxi 1
18 1 . . . parsed_1nxi 1
19 1 . . . parsed_1nxi 1
20 1 . . . parsed_1nxi 1
21 1 . . . parsed_1nxi 1
22 1 . . . parsed_1nxi 1
23 1 . . . parsed_1nxi 1
24 1 . . . parsed_1nxi 1
25 1 . . . parsed_1nxi 1
26 1 . . . parsed_1nxi 1
27 1 . . . parsed_1nxi 1
28 1 . . . parsed_1nxi 1
29 1 . . . parsed_1nxi 1
30 1 . . . parsed_1nxi 1
31 1 . . . parsed_1nxi 1
32 1 . . . parsed_1nxi 1
33 1 . . . parsed_1nxi 1
34 1 . . . parsed_1nxi 1
35 1 . . . parsed_1nxi 1
36 1 . . . parsed_1nxi 1
37 1 . . . parsed_1nxi 1
38 1 . . . parsed_1nxi 1
39 1 . . . parsed_1nxi 1
40 1 . . . parsed_1nxi 1
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45 1 . . . parsed_1nxi 1
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50 1 . . . parsed_1nxi 1
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55 1 . . . parsed_1nxi 1
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59 1 . . . parsed_1nxi 1
60 1 . . . parsed_1nxi 1
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62 1 . . . parsed_1nxi 1
63 1 . . . parsed_1nxi 1
64 1 . . . parsed_1nxi 1
65 1 . . . parsed_1nxi 1
66 1 . . . parsed_1nxi 1
67 1 . . . parsed_1nxi 1
68 1 . . . parsed_1nxi 1
69 1 . . . parsed_1nxi 1
70 1 . . . parsed_1nxi 1
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100 1 . . . parsed_1nxi 1
101 1 . . . parsed_1nxi 1
102 1 . . . parsed_1nxi 1
103 1 . . . parsed_1nxi 1
104 1 . . . parsed_1nxi 1
105 1 . . . parsed_1nxi 1
106 1 . . . parsed_1nxi 1
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109 1 . . . parsed_1nxi 1
110 1 . . . parsed_1nxi 1
111 1 . . . parsed_1nxi 1
112 1 . . . parsed_1nxi 1
113 1 . . . parsed_1nxi 1
114 1 . . . parsed_1nxi 1
115 1 . . . parsed_1nxi 1
116 1 . . . parsed_1nxi 1
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
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_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 11 . O parsed_1nxi 1
1 1 2 . . . . . . . . . 15 . N parsed_1nxi 1
2 1 1 . . . . . . . . . 11 . O parsed_1nxi 1
2 1 2 . . . . . . . . . 15 . HN parsed_1nxi 1
3 1 1 . . . . . . . . . 12 . O parsed_1nxi 1
3 1 2 . . . . . . . . . 16 . N parsed_1nxi 1
4 1 1 . . . . . . . . . 12 . O parsed_1nxi 1
4 1 2 . . . . . . . . . 16 . HN parsed_1nxi 1
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6 1 1 . . . . . . . . . 13 . O parsed_1nxi 1
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8 1 2 . . . . . . . . . 18 . HN parsed_1nxi 1
9 1 1 . . . . . . . . . 15 . O parsed_1nxi 1
9 1 2 . . . . . . . . . 19 . N parsed_1nxi 1
10 1 1 . . . . . . . . . 15 . O parsed_1nxi 1
10 1 2 . . . . . . . . . 19 . HN parsed_1nxi 1
11 1 1 . . . . . . . . . 16 . O parsed_1nxi 1
11 1 2 . . . . . . . . . 20 . N parsed_1nxi 1
12 1 1 . . . . . . . . . 16 . O parsed_1nxi 1
12 1 2 . . . . . . . . . 20 . HN parsed_1nxi 1
13 1 1 . . . . . . . . . 17 . O parsed_1nxi 1
13 1 2 . . . . . . . . . 21 . N parsed_1nxi 1
14 1 1 . . . . . . . . . 17 . O parsed_1nxi 1
14 1 2 . . . . . . . . . 21 . HN parsed_1nxi 1
15 1 1 . . . . . . . . . 18 . O parsed_1nxi 1
15 1 2 . . . . . . . . . 22 . N parsed_1nxi 1
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16 1 2 . . . . . . . . . 22 . HN parsed_1nxi 1
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19 1 2 . . . . . . . . . 24 . N parsed_1nxi 1
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20 1 2 . . . . . . . . . 24 . HN parsed_1nxi 1
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21 1 2 . . . . . . . . . 25 . N parsed_1nxi 1
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25 1 2 . . . . . . . . . 27 . N parsed_1nxi 1
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26 1 2 . . . . . . . . . 27 . HN parsed_1nxi 1
27 1 1 . . . . . . . . . 24 . O parsed_1nxi 1
27 1 2 . . . . . . . . . 28 . N parsed_1nxi 1
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29 1 2 . . . . . . . . . 29 . N parsed_1nxi 1
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30 1 2 . . . . . . . . . 29 . HN parsed_1nxi 1
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54 1 2 . . . . . . . . . 56 . HN parsed_1nxi 1
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55 1 2 . . . . . . . . . 57 . N parsed_1nxi 1
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loop_
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loop_
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
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save_CNS/XPLOR_distance_constraints_3
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_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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21
;
side chain amide protons
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;
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stop_
loop_
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1
;
table of backbone dihedrals
: PHI CONSTRAINTS
: HELIX
;
1 1 5 16 parsed_1nxi 1
2 "phi is restrained to -57 + or - 25 degrees for J < 6" 6 1 6 55 parsed_1nxi 1
3 ": SHEET" 88 1 88 16 parsed_1nxi 1
4 "phi is restrained to -139 (used to be -120) + or - 40 degrees for J > 8" 89 1 89 74 parsed_1nxi 1
5 ": OTHER" 132 1 132 15 parsed_1nxi 1
6 "phi is restrained to -57 + or - 30 degrees for J < 6" 133 1 133 55 parsed_1nxi 1
7 "phi is restrained to -130 + or - 50 degrees for J > 8" 138 1 138 56 parsed_1nxi 1
8
;
: PSI CONSTRAINTS
: HELIX
;
146 1 148 16 parsed_1nxi 1
9 ": SHEET" 271 1 271 15 parsed_1nxi 1
10
;
: X1 restraints
: Threonine
;
340 1 342 20 parsed_1nxi 1
11 "T21, HNHB small, NOEab small, constrained to g+" 344 1 344 50 parsed_1nxi 1
12 "T120, HNHB small, NOEab strong, constrained to t" 348 1 348 51 parsed_1nxi 1
13 ": Isoleucine" 352 1 352 21 parsed_1nxi 1
14 "I24, HNHB small, NOEab small, constrained to g+" 353 1 353 50 parsed_1nxi 1
15 "I25, HNHB small, NOEab small, constrained to g+" 357 1 357 50 parsed_1nxi 1
16 "I41, HNHB small, NOEab small, constrained to g+" 361 1 361 50 parsed_1nxi 1
17 "I97, HNHB small, NOEab small, constrained to g+" 365 1 365 50 parsed_1nxi 1
18 "I113, HNHB strong, constrained to g-" 369 1 369 39 parsed_1nxi 1
19 "I114, HNHB small, NOEab strong, constrained to t" 373 1 373 51 parsed_1nxi 1
20 ": Valine" 377 1 377 17 parsed_1nxi 1
21 "V67, HNHB small, NOEab med, constrained to g-" 378 1 378 48 parsed_1nxi 1
22 "V101, HNHB small, NOEab small, constrained to t" 382 1 382 50 parsed_1nxi 1
23 "V105, HNHB small, NOEab small, constrained to t" 386 1 386 50 parsed_1nxi 1
stop_
save_
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