data_4ms5_residue save_MolProbity _Software.Sf_category software _Software.Sf_framecode MolProbity _Software.Entry_ID ? _Software.ID 1 _Software.Name MolProbity _Software.Version 4.0 _Software.Details . save_ save_CYRANGE _Software.Sf_category software _Software.Sf_framecode CYRANGE _Software.Entry_ID ? _Software.ID 2 _Software.Name CYRANGE _Software.Version 2.0 _Software.Details . save_ save_Structure_validation_residue _Structure_validation_residue.Sf_category structure_validation _Structure_validation_residue.Sf_framecode Structure_validation_residue _Structure_validation_residue.Entry_ID ? _Structure_validation_residue.List_ID 1 _Structure_validation_residue.PDB_accession_code 4ms5 _Structure_validation_residue.Date_analyzed 2016-10-12 loop_ _Residue_analysis_software.Software_ID _Residue_analysis_software.Software_label _Residue_analysis_software.Method_ID _Residue_analysis_software.Method_label _Residue_analysis_software.Entry_ID _Residue_analysis_software.Structure_validation_oneline_list_ID 1 MolProbity . . ? 1 2 CYRANGE . . ? 1 stop_ loop_ _Residue_analysis.ID _Residue_analysis.PDB_model_num _Residue_analysis.Hydrogen_positions _Residue_analysis.MolProbity_flips _Residue_analysis.Cyrange_core_flag _Residue_analysis.Two_letter_chain_ID _Residue_analysis.PDB_strand_ID _Residue_analysis.PDB_residue_no _Residue_analysis.PDB_ins_code _Residue_analysis.PDB_residue_name _Residue_analysis.Assembly_ID _Residue_analysis.Entity_assembly_ID _Residue_analysis.Entity_ID _Residue_analysis.Comp_ID _Residue_analysis.Comp_index_ID _Residue_analysis.Clash_value _Residue_analysis.Clash_source_PDB_atom_name _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_atom_name _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_strand_ID _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_residue_no _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_ins_code _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_residue_name _Residue_analysis.Cbeta_deviation_value _Residue_analysis.Rotamer_score _Residue_analysis.Rotamer_name _Residue_analysis.Ramachandran_phi _Residue_analysis.Ramachandran_psi _Residue_analysis.Ramachandran_score _Residue_analysis.Ramachandran_evaluation _Residue_analysis.Ramachandran_type _Residue_analysis.Bond_outlier_count _Residue_analysis.Worst_bond _Residue_analysis.Worst_bond_value _Residue_analysis.Worst_bond_sigma _Residue_analysis.Angle_outlier_count _Residue_analysis.Worst_angle _Residue_analysis.Worst_angle_value _Residue_analysis.Worst_angle_sigma _Residue_analysis.RNA_phosphate_perpendicular_outlier _Residue_analysis.RNA_suitness_score _Residue_analysis.RNA_suite_conformer _Residue_analysis.RNA_suite_triage _Residue_analysis.Max_b_factor _Residue_analysis.Tau_angle _Residue_analysis.Omega_dihedral _Residue_analysis.Disulfide_chi1 _Residue_analysis.Disulfide_chi2 _Residue_analysis.Disulfide_chi3 _Residue_analysis.Disulfide_ss_angle _Residue_analysis.Disulfide_ss _Residue_analysis.Disulfide_ss_angle_prime _Residue_analysis.Disulfide_chi2prime _Residue_analysis.Disulfide_chi1prime _Residue_analysis.Outlier_count_separate_geometry _Residue_analysis.Outlier_count _Residue_analysis.Entry_ID _Residue_analysis.Structure_validation_residue_list_ID . 001 ecloud orig full ' A' A ' 1' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 C5'--C4' 1.515 0.441 0 C5'-C4'-O4' 115.626 3.891 . . . . 54.380000000000003 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 2' ' ' ' DC' . . . . . 0.424 " C5'" ' O ' ' A' ' 213' ' ' HOH . . . . . . . . 0 P--O3' 1.588 -1.569 0 C3'-C2'-C1' 106.343 2.602 . . . . 50.600000000000001 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 3' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 P--O3' 1.576 -2.572 0 C4'-C3'-O3' 106.244 -1.844 . . . . 36.600000000000001 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 4' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O3' 1.55 -4.734 0 C4'-C3'-O3' 105.846 -2.024 . . . . 42.789999999999999 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 5' ' ' ' DA' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O5'--C5' 1.415 -1.545 0 O5'-P-OP2 101.303 -2.592 . . . . 57.530000000000001 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 6' ' ' ' DT' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 P--O3' 1.576 -2.56 0 C2'-C3'-O3' 114.961 1.615 . . . . 64.670000000000002 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 7' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O5'--C5' 1.419 -1.317 0 O5'-C5'-C4' 106.208 -2.851 . . . . 61.829999999999998 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 8' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 P--O3' 1.569 -3.191 0 O4'-C4'-C3' 103.146 -2.454 . . . . 37.5 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 9' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O3' 1.558 -4.054 0 O5'-C5'-C4' 106.886 -2.367 . . . . 51.969999999999999 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 10' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 P--O3' 1.594 -1.085 0 O5'-P-OP2 112.04 1.385 . . . . 67.980000000000004 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 101' ' ' ' BA' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 102' ' ' RKF . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 201' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 202' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 203' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 204' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 205' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 206' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 207' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 208' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 209' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 210' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 211' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 212' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 213' ' ' HOH . . . . . 0.424 ' O ' " C5'" ' A' ' 2' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 214' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 215' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 1' ' ' ' DC' . . . . . 0.507 " H4'" ' OP1' ' A' ' 2' ' ' ' DC' . . . . . . . . 0 C5'--C4' 1.515 0.441 0 C5'-C4'-O4' 115.626 3.891 . . . . 54.380000000000003 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 2' ' ' ' DC' . . . . . 0.507 ' OP1' " H4'" ' A' ' 1' ' ' ' DC' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.588 -1.569 0 C3'-C2'-C1' 106.343 2.602 . . . . 50.600000000000001 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 3' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 P--O3' 1.576 -2.572 0 C4'-C3'-O3' 106.244 -1.844 . . . . 36.600000000000001 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 4' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O3' 1.55 -4.734 0 C4'-C3'-O3' 105.846 -2.024 . . . . 42.789999999999999 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 5' ' ' ' DA' . . . . . 0.477 " H2'" ' H71' ' A' ' 6' ' ' ' DT' . . . . . . . . 0 O5'--C5' 1.415 -1.545 0 O5'-P-OP2 101.303 -2.592 . . . . 57.530000000000001 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 6' ' ' ' DT' . . . . . 0.477 ' H71' " H2'" ' A' ' 5' ' ' ' DA' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.576 -2.56 0 C2'-C3'-O3' 114.961 1.615 . . . . 64.670000000000002 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 7' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O5'--C5' 1.419 -1.317 0 O5'-C5'-C4' 106.208 -2.851 . . . . 61.829999999999998 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 8' ' ' ' DC' . . . . . 0.436 " H2'" ' C8 ' ' A' ' 9' ' ' ' DG' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.569 -3.191 0 O4'-C4'-C3' 103.146 -2.454 . . . . 37.5 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 9' ' ' ' DG' . . . . . 0.436 ' C8 ' " H2'" ' A' ' 8' ' ' ' DC' . . . . . . . . 1 P--O3' 1.558 -4.054 0 O5'-C5'-C4' 106.886 -2.367 . . . . 51.969999999999999 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 10' ' ' ' DG' . . . . . 0.427 ' N3 ' " H3'" ' A' ' 10' ' ' ' DG' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.594 -1.085 0 O5'-P-OP2 112.04 1.385 . . . . 67.980000000000004 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 101' ' ' ' BA' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 102' ' ' RKF . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 201' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 202' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 203' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 204' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 205' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 206' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 207' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 208' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 209' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 210' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 211' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 212' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 213' ' ' HOH . . . . . 0.5 ' O ' H5'' ' A' ' 2' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 214' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 215' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 1' ' ' ' DC' . . . . . 0.507 " H4'" ' OP1' ' A' ' 2' ' ' ' DC' . . . . . . . . 0 C5'--C4' 1.515 0.441 0 C5'-C4'-O4' 115.626 3.891 . . . . 54.380000000000003 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 2' ' ' ' DC' . . . . . 0.507 ' OP1' " H4'" ' A' ' 1' ' ' ' DC' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.588 -1.569 0 C3'-C2'-C1' 106.343 2.602 . . . . 50.600000000000001 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 3' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 P--O3' 1.576 -2.572 0 C4'-C3'-O3' 106.244 -1.844 . . . . 36.600000000000001 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 4' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O3' 1.55 -4.734 0 C4'-C3'-O3' 105.846 -2.024 . . . . 42.789999999999999 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 5' ' ' ' DA' . . . . . 0.477 " H2'" ' H71' ' A' ' 6' ' ' ' DT' . . . . . . . . 0 O5'--C5' 1.415 -1.545 0 O5'-P-OP2 101.303 -2.592 . . . . 57.530000000000001 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 6' ' ' ' DT' . . . . . 0.477 ' H71' " H2'" ' A' ' 5' ' ' ' DA' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.576 -2.56 0 C2'-C3'-O3' 114.961 1.615 . . . . 64.670000000000002 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 7' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O5'--C5' 1.419 -1.317 0 O5'-C5'-C4' 106.208 -2.851 . . . . 61.829999999999998 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 8' ' ' ' DC' . . . . . 0.436 " H2'" ' C8 ' ' A' ' 9' ' ' ' DG' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.569 -3.191 0 O4'-C4'-C3' 103.146 -2.454 . . . . 37.5 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 9' ' ' ' DG' . . . . . 0.436 ' C8 ' " H2'" ' A' ' 8' ' ' ' DC' . . . . . . . . 1 P--O3' 1.558 -4.054 0 O5'-C5'-C4' 106.886 -2.367 . . . . 51.969999999999999 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 10' ' ' ' DG' . . . . . 0.427 ' N3 ' " H3'" ' A' ' 10' ' ' ' DG' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.594 -1.085 0 O5'-P-OP2 112.04 1.385 . . . . 67.980000000000004 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 101' ' ' ' BA' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 102' ' ' RKF . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 201' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 202' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 203' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 204' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 205' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 206' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 207' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 208' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 209' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 210' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 211' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 212' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 213' ' ' HOH . . . . . 0.5 ' O ' H5'' ' A' ' 2' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 214' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 215' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 stop_ save_