data_1vtf_residue save_MolProbity _Software.Sf_category software _Software.Sf_framecode MolProbity _Software.Entry_ID ? _Software.ID 1 _Software.Name MolProbity _Software.Version 4.0 _Software.Details . save_ save_CYRANGE _Software.Sf_category software _Software.Sf_framecode CYRANGE _Software.Entry_ID ? _Software.ID 2 _Software.Name CYRANGE _Software.Version 2.0 _Software.Details . save_ save_Structure_validation_residue _Structure_validation_residue.Sf_category structure_validation _Structure_validation_residue.Sf_framecode Structure_validation_residue _Structure_validation_residue.Entry_ID ? _Structure_validation_residue.List_ID 1 _Structure_validation_residue.PDB_accession_code 1vtf _Structure_validation_residue.Date_analyzed 2016-10-12 loop_ _Residue_analysis_software.Software_ID _Residue_analysis_software.Software_label _Residue_analysis_software.Method_ID _Residue_analysis_software.Method_label _Residue_analysis_software.Entry_ID _Residue_analysis_software.Structure_validation_oneline_list_ID 1 MolProbity . . ? 1 2 CYRANGE . . ? 1 stop_ loop_ _Residue_analysis.ID _Residue_analysis.PDB_model_num _Residue_analysis.Hydrogen_positions _Residue_analysis.MolProbity_flips _Residue_analysis.Cyrange_core_flag _Residue_analysis.Two_letter_chain_ID _Residue_analysis.PDB_strand_ID _Residue_analysis.PDB_residue_no _Residue_analysis.PDB_ins_code _Residue_analysis.PDB_residue_name _Residue_analysis.Assembly_ID _Residue_analysis.Entity_assembly_ID _Residue_analysis.Entity_ID _Residue_analysis.Comp_ID _Residue_analysis.Comp_index_ID _Residue_analysis.Clash_value _Residue_analysis.Clash_source_PDB_atom_name _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_atom_name _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_strand_ID _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_residue_no _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_ins_code _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_residue_name _Residue_analysis.Cbeta_deviation_value _Residue_analysis.Rotamer_score _Residue_analysis.Rotamer_name _Residue_analysis.Ramachandran_phi _Residue_analysis.Ramachandran_psi _Residue_analysis.Ramachandran_score _Residue_analysis.Ramachandran_evaluation _Residue_analysis.Ramachandran_type _Residue_analysis.Bond_outlier_count _Residue_analysis.Worst_bond _Residue_analysis.Worst_bond_value _Residue_analysis.Worst_bond_sigma _Residue_analysis.Angle_outlier_count _Residue_analysis.Worst_angle _Residue_analysis.Worst_angle_value _Residue_analysis.Worst_angle_sigma _Residue_analysis.RNA_phosphate_perpendicular_outlier _Residue_analysis.RNA_suitness_score _Residue_analysis.RNA_suite_conformer _Residue_analysis.RNA_suite_triage _Residue_analysis.Max_b_factor _Residue_analysis.Tau_angle _Residue_analysis.Omega_dihedral _Residue_analysis.Disulfide_chi1 _Residue_analysis.Disulfide_chi2 _Residue_analysis.Disulfide_chi3 _Residue_analysis.Disulfide_ss_angle _Residue_analysis.Disulfide_ss _Residue_analysis.Disulfide_ss_angle_prime _Residue_analysis.Disulfide_chi2prime _Residue_analysis.Disulfide_chi1prime _Residue_analysis.Outlier_count_separate_geometry _Residue_analysis.Outlier_count _Residue_analysis.Entry_ID _Residue_analysis.Structure_validation_residue_list_ID . 001 ecloud orig full ' A' A ' 1' ' ' CBR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.395 -4.644 0 C1'-O4'-C4' 113.931 3.022 . . . . 24.670000000000002 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 2' ' ' ' DG' . . . . . 0.764 " C2'" 'BR ' ' A' ' 3' ' ' CBR . . . . . . . . 2 P--O3' 1.531 -6.358 4 P-O3'-C3' 130.181 8.734 . . . . 14.25 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 3' ' ' CBR . . . . . 0.764 'BR ' " C2'" ' A' ' 2' ' ' ' DG' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.645 3.168 4 P-O5'-C5' 107.733 -8.23 . . . . 17.34 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 4' ' ' ' DG' . . . . . 0.677 ' C2 ' " O4'" ' A' ' 3' ' ' CBR . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.418 -2.515 2 O3'-P-O5' 117.248 6.973 . . . . 15.93 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 5' ' ' CBR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.415 -2.846 1 O4'-C1'-N19 112.831 6.289 . . . . 24.600000000000001 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 6' ' ' ' DG' . . . . . 0.472 ' C6 ' ' N4 ' ' B' ' 7' ' ' CBR . . . . . . . . 1 P--O3' 1.721 9.539 2 O5'-C5'-C4' 102.096 -5.789 . . . . 9.2200000000000006 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 7' ' ' CBR . . . . . 0.486 ' O2 ' ' N15' ' A' ' 13' ' ' PRL . . . . . . . . 2 P--O5' 1.67 7.674 2 P-O5'-C5' 101.033 -12.417 . . . . 15.93 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 8' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 P--O3' 1.696 7.416 2 O4'-C1'-N19 96.084 -14.645 . . . . 18.309999999999999 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 9' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 10' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 11' ' ' PRL . . . . . 0.404 ' N15' ' N2 ' ' B' ' 6' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 12' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 13' ' ' PRL . . . . . 0.486 ' N15' ' O2 ' ' B' ' 7' ' ' CBR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 14' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 15' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 1' ' ' CBR . . . . . 0.458 ' H6 ' " O5'" ' A' ' 1' ' ' CBR . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.395 -4.644 0 C1'-O4'-C4' 113.931 3.022 . . . . 24.670000000000002 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 2' ' ' ' DG' . . . . . 1.25 " H2'" 'BR ' ' A' ' 3' ' ' CBR . . . . . . . . 2 P--O3' 1.531 -6.358 4 P-O3'-C3' 130.181 8.734 . . . . 14.25 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 3' ' ' CBR . . . . . 1.25 'BR ' " H2'" ' A' ' 2' ' ' ' DG' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.645 3.168 4 P-O5'-C5' 107.733 -8.23 . . . . 17.34 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 4' ' ' ' DG' . . . . . 0.677 ' C2 ' " O4'" ' A' ' 3' ' ' CBR . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.418 -2.515 2 O3'-P-O5' 117.248 6.973 . . . . 15.93 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 5' ' ' CBR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.415 -2.846 1 O4'-C1'-N19 112.831 6.289 . . . . 24.600000000000001 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 6' ' ' ' DG' . . . . . 0.594 ' OP2' ' H8 ' ' B' ' 14' ' ' PRL . . . . . . . . 1 P--O3' 1.721 9.539 2 O5'-C5'-C4' 102.096 -5.789 . . . . 9.2200000000000006 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 7' ' ' CBR . . . . . 0.738 " H4'" H5'' ' B' ' 8' ' ' ' DG' . . . . . . . . 2 P--O5' 1.67 7.674 2 P-O5'-C5' 101.033 -12.417 . . . . 15.93 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 8' ' ' ' DG' . . . . . 0.738 H5'' " H4'" ' B' ' 7' ' ' CBR . . . . . . . . 3 P--O3' 1.696 7.416 2 O4'-C1'-N19 96.084 -14.645 . . . . 18.309999999999999 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 9' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 10' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 11' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 12' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 13' ' ' PRL . . . . . 0.66 ' H1 ' ' OP2' ' B' ' 8' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 14' ' ' PRL . . . . . 0.594 ' H8 ' ' OP2' ' B' ' 6' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 15' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 1' ' ' CBR . . . . . 0.458 " O5'" ' H6 ' ' A' ' 1' ' ' CBR . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.395 -4.644 0 C1'-O4'-C4' 113.931 3.022 . . . . 24.67 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 2' ' ' ' DG' . . . . . 1.25 " H2'" 'BR ' ' A' ' 3' ' ' CBR . . . . . . . . 2 P--O3' 1.531 -6.358 4 P-O3'-C3' 130.181 8.734 . . . . 14.25 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 3' ' ' CBR . . . . . 1.25 'BR ' " H2'" ' A' ' 2' ' ' ' DG' . . . . . . . . 0 P--O3' 1.645 3.168 4 P-O5'-C5' 107.733 -8.23 . . . . 17.34 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 4' ' ' ' DG' . . . . . 0.677 ' C2 ' " O4'" ' A' ' 3' ' ' CBR . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.418 -2.515 2 O3'-P-O5' 117.248 6.973 . . . . 15.93 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 5' ' ' CBR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.415 -2.846 1 O4'-C1'-N19 112.831 6.289 . . . . 24.6 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 6' ' ' ' DG' . . . . . 0.594 ' OP2' ' H8 ' ' B' ' 14' ' ' PRL . . . . . . . . 1 P--O3' 1.721 9.539 2 O5'-C5'-C4' 102.096 -5.789 . . . . 9.22 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 7' ' ' CBR . . . . . 0.738 " H4'" H5'' ' B' ' 8' ' ' ' DG' . . . . . . . . 2 P--O5' 1.67 7.674 2 P-O5'-C5' 101.033 -12.417 . . . . 15.93 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 8' ' ' ' DG' . . . . . 0.738 H5'' " H4'" ' B' ' 7' ' ' CBR . . . . . . . . 3 P--O3' 1.696 7.416 2 O4'-C1'-N19 96.084 -14.645 . . . . 18.31 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 9' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 10' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 11' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 12' ' ' PRL . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 13' ' ' PRL . . . . . 0.66 ' H1 ' ' OP2' ' B' ' 8' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 14' ' ' PRL . . . . . 0.594 ' H8 ' ' OP2' ' B' ' 6' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 15' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 stop_ save_